Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NUPL2O15504 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUPL2O15504 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms