Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GNPATO15228 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GNPATO15228 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GNPATO15228 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GNPATO15228 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GNPATO15228 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GNPATO15228 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GNPATO15228 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GNPATO15228 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GNPATO15228 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GNPATO15228 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GNPATO15228 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GNPATO15228 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GNPATO15228 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GNPATO15228 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GNPATO15228 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GNPATO15228 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GNPATO15228 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GNPATO15228 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GNPATO15228 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GNPATO15228 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GNPATO15228 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GNPATO15228 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GNPATO15228 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GNPATO15228 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GNPATO15228 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GNPATO15228 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GNPATO15228 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GNPATO15228 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GNPATO15228 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GNPATO15228 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GNPATO15228 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GNPATO15228 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GNPATO15228 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GNPATO15228 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GNPATO15228 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GNPATO15228 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GNPATO15228 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GNPATO15228 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GNPATO15228 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GNPATO15228 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GNPATO15228 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GNPATO15228 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GNPATO15228 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GNPATO15228 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GNPATO15228 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GNPATO15228 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GNPATO15228 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GNPATO15228 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GNPATO15228 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GNPATO15228 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GNPATO15228 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GNPATO15228 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNPATO15228 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNPATO15228 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNPATO15228 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNPATO15228 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNPATO15228 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNPATO15228 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNPATO15228 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNPATO15228 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNPATO15228 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNPATO15228 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GNPATO15228 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GNPATO15228 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GNPATO15228 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GNPATO15228 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GNPATO15228 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GNPATO15228 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GNPATO15228 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GNPATO15228 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
GNPATO15228 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GNPATO15228 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GNPATO15228 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GNPATO15228 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GNPATO15228 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GNPATO15228 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GNPATO15228 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GNPATO15228 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GNPATO15228 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GNPATO15228 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GNPATO15228 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GNPATO15228 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GNPATO15228 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GNPATO15228 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GNPATO15228 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GNPATO15228 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPATO15228 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPATO15228 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPATO15228 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPATO15228 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPATO15228 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPATO15228 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPATO15228 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPATO15228 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPATO15228 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPATO15228 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPATO15228 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPATO15228 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPATO15228 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms