Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHUKO15111 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHUKO15111 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHUKO15111 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHUKO15111 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHUKO15111 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHUKO15111 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHUKO15111 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHUKO15111 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHUKO15111 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHUKO15111 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHUKO15111 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHUKO15111 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHUKO15111 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHUKO15111 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHUKO15111 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHUKO15111 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHUKO15111 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHUKO15111 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHUKO15111 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHUKO15111 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHUKO15111 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHUKO15111 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHUKO15111 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHUKO15111 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHUKO15111 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHUKO15111 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHUKO15111 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHUKO15111 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHUKO15111 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHUKO15111 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHUKO15111 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHUKO15111 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHUKO15111 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHUKO15111 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHUKO15111 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHUKO15111 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHUKO15111 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHUKO15111 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHUKO15111 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHUKO15111 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHUKO15111 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHUKO15111 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHUKO15111 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHUKO15111 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHUKO15111 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHUKO15111 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHUKO15111 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHUKO15111 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHUKO15111 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHUKO15111 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHUKO15111 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHUKO15111 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHUKO15111 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHUKO15111 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHUKO15111 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHUKO15111 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHUKO15111 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHUKO15111 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHUKO15111 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHUKO15111 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHUKO15111 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHUKO15111 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHUKO15111 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHUKO15111 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHUKO15111 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHUKO15111 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHUKO15111 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHUKO15111 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHUKO15111 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHUKO15111 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHUKO15111 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHUKO15111 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHUKO15111 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHUKO15111 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHUKO15111 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHUKO15111 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHUKO15111 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHUKO15111 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHUKO15111 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHUKO15111 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHUKO15111 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms