Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYNMO15061 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYNMO15061 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYNMO15061 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYNMO15061 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYNMO15061 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SYNMO15061 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SYNMO15061 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SYNMO15061 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SYNMO15061 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SYNMO15061 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SYNMO15061 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SYNMO15061 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SYNMO15061 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SYNMO15061 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
SYNMO15061 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
SYNMO15061 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
SYNMO15061 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYNMO15061 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYNMO15061 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYNMO15061 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYNMO15061 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYNMO15061 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYNMO15061 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
SYNMO15061 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SYNMO15061 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SYNMO15061 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SYNMO15061 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SYNMO15061 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SYNMO15061 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SYNMO15061 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
SYNMO15061 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYNMO15061 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYNMO15061 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
SYNMO15061 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYNMO15061 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
SYNMO15061 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYNMO15061 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYNMO15061 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYNMO15061 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYNMO15061 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
SYNMO15061 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYNMO15061 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYNMO15061 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYNMO15061 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYNMO15061 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYNMO15061 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYNMO15061 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYNMO15061 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYNMO15061 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYNMO15061 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYNMO15061 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYNMO15061 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SYNMO15061 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYNMO15061 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYNMO15061 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYNMO15061 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYNMO15061 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYNMO15061 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYNMO15061 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
SYNMO15061 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYNMO15061 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYNMO15061 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYNMO15061 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYNMO15061 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYNMO15061 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYNMO15061 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYNMO15061 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYNMO15061 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYNMO15061 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYNMO15061 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYNMO15061 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYNMO15061 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYNMO15061 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYNMO15061 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYNMO15061 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SYNMO15061 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYNMO15061 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYNMO15061 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYNMO15061 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYNMO15061 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYNMO15061 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYNMO15061 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYNMO15061 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYNMO15061 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYNMO15061 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYNMO15061 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
SYNMO15061 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYNMO15061 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYNMO15061 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYNMO15061 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYNMO15061 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYNMO15061 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYNMO15061 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYNMO15061 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYNMO15061 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYNMO15061 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYNMO15061 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYNMO15061 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYNMO15061 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms