Protein–RNA interactions for Protein: O14827

RASGRF2, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF2O14827 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGRF2O14827 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGRF2O14827 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGRF2O14827 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGRF2O14827 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGRF2O14827 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGRF2O14827 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RASGRF2O14827 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RASGRF2O14827 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGRF2O14827 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms