Protein–RNA interactions for Protein: O14787

TNPO2, Transportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO2O14787 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO2O14787 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNPO2O14787 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms