Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APAF1O14727 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APAF1O14727 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APAF1O14727 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APAF1O14727 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APAF1O14727 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APAF1O14727 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APAF1O14727 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APAF1O14727 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APAF1O14727 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
APAF1O14727 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
APAF1O14727 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APAF1O14727 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APAF1O14727 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APAF1O14727 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APAF1O14727 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APAF1O14727 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APAF1O14727 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APAF1O14727 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APAF1O14727 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APAF1O14727 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APAF1O14727 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APAF1O14727 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APAF1O14727 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APAF1O14727 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APAF1O14727 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APAF1O14727 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APAF1O14727 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
APAF1O14727 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APAF1O14727 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APAF1O14727 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
APAF1O14727 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
APAF1O14727 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
APAF1O14727 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
APAF1O14727 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APAF1O14727 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APAF1O14727 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APAF1O14727 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APAF1O14727 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APAF1O14727 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APAF1O14727 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APAF1O14727 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APAF1O14727 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APAF1O14727 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APAF1O14727 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APAF1O14727 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APAF1O14727 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APAF1O14727 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APAF1O14727 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APAF1O14727 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APAF1O14727 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APAF1O14727 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APAF1O14727 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APAF1O14727 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APAF1O14727 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APAF1O14727 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APAF1O14727 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APAF1O14727 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APAF1O14727 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APAF1O14727 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
APAF1O14727 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
APAF1O14727 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APAF1O14727 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APAF1O14727 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
APAF1O14727 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APAF1O14727 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APAF1O14727 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APAF1O14727 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APAF1O14727 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APAF1O14727 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APAF1O14727 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APAF1O14727 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APAF1O14727 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APAF1O14727 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
APAF1O14727 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APAF1O14727 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APAF1O14727 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APAF1O14727 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APAF1O14727 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APAF1O14727 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APAF1O14727 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APAF1O14727 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APAF1O14727 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APAF1O14727 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
APAF1O14727 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
APAF1O14727 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APAF1O14727 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APAF1O14727 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
APAF1O14727 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APAF1O14727 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APAF1O14727 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APAF1O14727 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APAF1O14727 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
APAF1O14727 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APAF1O14727 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APAF1O14727 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APAF1O14727 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APAF1O14727 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
APAF1O14727 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APAF1O14727 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms