Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms