Protein–RNA interactions for Protein: O14524

NEMP1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP1O14524 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMP1O14524 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMP1O14524 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMP1O14524 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMP1O14524 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMP1O14524 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMP1O14524 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMP1O14524 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMP1O14524 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEMP1O14524 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMP1O14524 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMP1O14524 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMP1O14524 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMP1O14524 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEMP1O14524 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEMP1O14524 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms