Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX7O00628 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX7O00628 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX7O00628 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX7O00628 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX7O00628 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX7O00628 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX7O00628 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX7O00628 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX7O00628 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX7O00628 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX7O00628 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX7O00628 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX7O00628 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX7O00628 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX7O00628 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX7O00628 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX7O00628 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX7O00628 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX7O00628 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX7O00628 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX7O00628 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX7O00628 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX7O00628 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX7O00628 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX7O00628 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX7O00628 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX7O00628 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX7O00628 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX7O00628 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX7O00628 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX7O00628 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX7O00628 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX7O00628 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX7O00628 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX7O00628 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX7O00628 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX7O00628 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX7O00628 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX7O00628 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX7O00628 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX7O00628 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX7O00628 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX7O00628 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX7O00628 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX7O00628 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX7O00628 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX7O00628 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX7O00628 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX7O00628 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX7O00628 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX7O00628 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX7O00628 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX7O00628 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX7O00628 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX7O00628 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX7O00628 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX7O00628 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX7O00628 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX7O00628 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX7O00628 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX7O00628 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX7O00628 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX7O00628 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX7O00628 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX7O00628 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX7O00628 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX7O00628 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX7O00628 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms