Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms