Protein–RNA interactions for Protein: O00445

SYT5, Synaptotagmin-5, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5O00445 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT5O00445 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT5O00445 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT5O00445 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT5O00445 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT5O00445 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT5O00445 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT5O00445 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT5O00445 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT5O00445 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT5O00445 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT5O00445 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT5O00445 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT5O00445 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT5O00445 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT5O00445 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT5O00445 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT5O00445 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT5O00445 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT5O00445 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT5O00445 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT5O00445 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT5O00445 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT5O00445 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT5O00445 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT5O00445 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT5O00445 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT5O00445 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT5O00445 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT5O00445 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT5O00445 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT5O00445 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT5O00445 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT5O00445 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT5O00445 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT5O00445 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT5O00445 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT5O00445 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT5O00445 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT5O00445 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT5O00445 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT5O00445 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT5O00445 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT5O00445 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT5O00445 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT5O00445 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT5O00445 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT5O00445 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT5O00445 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT5O00445 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT5O00445 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT5O00445 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT5O00445 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT5O00445 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT5O00445 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT5O00445 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT5O00445 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT5O00445 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT5O00445 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT5O00445 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT5O00445 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT5O00445 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT5O00445 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT5O00445 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT5O00445 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT5O00445 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT5O00445 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT5O00445 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT5O00445 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT5O00445 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT5O00445 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT5O00445 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT5O00445 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT5O00445 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT5O00445 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT5O00445 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT5O00445 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT5O00445 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT5O00445 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT5O00445 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT5O00445 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms