Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE2AO00408 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE2AO00408 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms