Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10AO00220 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms