Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARVCFO00192 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARVCFO00192 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms