Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA8SH3BPF8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms