Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP99D6REC4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms