Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HNRNPCL3B7ZW38 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms