Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms