Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPBD1B2RD01 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPBD1B2RD01 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPBD1B2RD01 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPBD1B2RD01 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPBD1B2RD01 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPBD1B2RD01 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPBD1B2RD01 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CENPBD1B2RD01 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CENPBD1B2RD01 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CENPBD1B2RD01 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CENPBD1B2RD01 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CENPBD1B2RD01 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPBD1B2RD01 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPBD1B2RD01 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms