Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NNZ2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NNZ2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NNZ2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NNZ2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NNZ2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NNZ2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NNZ2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NNZ2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NNZ2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NNZ2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NNZ2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NNZ2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NNZ2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NNZ2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NNZ2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NNZ2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NNZ2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NNZ2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NNZ2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NNZ2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NNZ2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NNZ2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NNZ2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NNZ2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NNZ2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NNZ2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NNZ2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NNZ2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NNZ2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NNZ2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NNZ2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NNZ2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NNZ2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NNZ2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNZ2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNZ2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNZ2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNZ2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNZ2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNZ2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNZ2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNZ2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNZ2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNZ2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNZ2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNZ2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNZ2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NNZ2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NNZ2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NNZ2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NNZ2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NNZ2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NNZ2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NNZ2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NNZ2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NNZ2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NNZ2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NNZ2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NNZ2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NNZ2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A6NNZ2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
A6NNZ2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A6NNZ2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A6NNZ2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
A6NNZ2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
A6NNZ2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A6NNZ2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A6NNZ2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A6NNZ2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A6NNZ2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NNZ2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NNZ2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NNZ2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NNZ2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NNZ2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NNZ2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NNZ2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NNZ2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NNZ2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NNZ2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NNZ2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms