Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSDA5PKW4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms