Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A4D1N5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A4D1N5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
A4D1N5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A4D1N5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A4D1N5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A4D1N5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A4D1N5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A4D1N5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A4D1N5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A4D1N5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A4D1N5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A4D1N5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A4D1N5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A4D1N5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A4D1N5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A4D1N5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A4D1N5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A4D1N5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A4D1N5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A4D1N5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A4D1N5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A4D1N5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A4D1N5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A4D1N5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A4D1N5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A4D1N5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
A4D1N5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
A4D1N5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
A4D1N5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
A4D1N5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
A4D1N5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
A4D1N5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms