Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms