Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM30A4D0T7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms