Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD3A2A2Y4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms