Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEB3A0JP26 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms