Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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TCRBV5S1A1TA0A578 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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TCRBV5S1A1TA0A578 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
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TCRBV5S1A1TA0A578 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCRBV5S1A1TA0A578 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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TCRBV5S1A1TA0A578 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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TCRBV5S1A1TA0A578 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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TCRBV5S1A1TA0A578 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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TCRBV5S1A1TA0A578 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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TCRBV5S1A1TA0A578 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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TCRBV5S1A1TA0A578 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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TCRBV5S1A1TA0A578 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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TCRBV5S1A1TA0A578 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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TCRBV5S1A1TA0A578 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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TCRBV5S1A1TA0A578 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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TCRBV5S1A1TA0A578 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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TCRBV5S1A1TA0A578 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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TCRBV5S1A1TA0A578 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCRBV5S1A1TA0A578 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
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TCRBV5S1A1TA0A578 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
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