Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQD8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms