Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVM2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVM2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A1B0GVM2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GVM2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms