Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 FLVCR2-201ENST00000238667 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 NEK6-203ENST00000373600 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 PIK3CD-207ENST00000543390 3503 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 TMBIM1-214ENST00000444881 2936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 CAMTA2-208ENST00000572543 4496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 CYP1A1-202ENST00000395048 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 PPFIA2-227ENST00000552948 3976 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 USP3-202ENST00000380324 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 FAM131A-201ENST00000310585 3677 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 NT5DC2-201ENST00000307076 2047 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 KCNJ3-203ENST00000544049 4523 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 COX6B2-205ENST00000588572 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 AL138762.1-201ENST00000608554 1637 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 GRB10-210ENST00000407526 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 HSPA8-201ENST00000227378 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 C12orf74-202ENST00000544406 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 ARHGAP6-205ENST00000380736 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
OPALINQ96PE5 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 PHF21A-202ENST00000418153 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 TM2D2-202ENST00000456397 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SNRK-202ENST00000429705 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ZNF566-209ENST00000493391 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SPIN3-223ENST00000639525 3958 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 IPO13-202ENST00000372343 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 HNRNPR-202ENST00000374612 2694 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 HS6ST2-202ENST00000370836 4441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ETS2-202ENST00000360938 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 NXPE1-205ENST00000536312 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RTEL1P1-201ENST00000504490 3685 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 TMCO1-202ENST00000392129 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 MPP2-221ENST00000625880 4668 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RSPH10B2-201ENST00000297186 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RSPH10B-201ENST00000337579 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RAD52-204ENST00000430095 2366 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 RN7SKP90-201ENST00000363013 335 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC079905.2-201ENST00000550105 247 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 FPR2-201ENST00000340023 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 DOCK10-201ENST00000258390 7260 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SIRPB1-204ENST00000381603 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 TPTE-205ENST00000622113 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ZNF641-203ENST00000544117 7819 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 FOSB-206ENST00000586615 3774 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ACVR1-207ENST00000434821 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 BCL2L11-218ENST00000615946 5026 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 BCL2L11-220ENST00000620862 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 DEDD-210ENST00000490843 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 PLCD4-206ENST00000450993 3232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC002519.1-201ENST00000570073 2792 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ATL2-206ENST00000419554 2335 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 GUCD1-213ENST00000621833 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ATP6V1H-203ENST00000396774 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AKAP1-206ENST00000571629 3105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 SLC25A25-201ENST00000373064 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 UNC45B-203ENST00000591048 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 LACC1-201ENST00000325686 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 CDKL3-201ENST00000265334 2130 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 LMCD1-AS1-201ENST00000420095 2144 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 FAM177A1-203ENST00000396472 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OPALINQ96PE5 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms