Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ABCC12-201ENST00000311303 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 NPY2R-202ENST00000506608 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC022730.4-201ENST00000520259 2367 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SCN8A-208ENST00000599343 5976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 KIAA0895-202ENST00000317020 4241 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SLC24A3-202ENST00000613834 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TTK-208ENST00000509894 3725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TRIM39-204ENST00000396548 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 NSA2-201ENST00000296802 1199 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 OARD1-214ENST00000486443 764 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 GRAP2-201ENST00000344138 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SLC25A21-201ENST00000331299 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PLEKHB2-208ENST00000439822 4177 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 GOLGA6B-201ENST00000421285 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 RPS15A-201ENST00000322989 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PDXDC1-202ENST00000396410 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MARCH10-202ENST00000456609 3057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AL162274.3-201ENST00000623138 3109 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TMEM196-201ENST00000405764 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ERICH3-201ENST00000326665 7159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ARHGAP21-203ENST00000396432 7167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ITGB6-203ENST00000409872 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TPCN1-204ENST00000541517 5173 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 HIST1H3E-202ENST00000634733 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CYB561A3-201ENST00000294072 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 JCAD-201ENST00000375377 9265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 EPB41L2-232ENST00000628542 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 OGDH-205ENST00000444676 3309 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PIWIL2-202ENST00000454009 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MELK-209ENST00000541717 2363 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PCDH20-201ENST00000409204 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PMF1-BGLAP-201ENST00000320139 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 RBMXP2-201ENST00000434705 1168 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CDK2AP2P2-201ENST00000478512 367 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SMARCE1-202ENST00000348513 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ITIH4-212ENST00000485816 2990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CCDC14-201ENST00000310351 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MRPL45-204ENST00000619548 1554 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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