Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 IFI27L1-203ENST00000553664 647 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC020917.3-201ENST00000621050 721 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC092611.1-201ENST00000514269 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 FAM198B-202ENST00000393807 4544 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PRR19-202ENST00000499536 1956 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC093330.2-201ENST00000624814 3998 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CFAP36-202ENST00000349456 2048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 DUXAP8-202ENST00000413768 2102 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC097372.1-201ENST00000636502 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LINC01254-201ENST00000566225 2908 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SETDB1-202ENST00000368962 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SCAMP1-207ENST00000621999 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC005865.1-201ENST00000432994 3004 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ATG5-208ENST00000635758 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 UBR4-203ENST00000375225 1533 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SEPT10-201ENST00000356688 3091 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ANKRD42-203ENST00000393392 2302 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LCTL-201ENST00000341509 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SMAD3-204ENST00000540846 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 TAF5L-203ENST00000366675 4062 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ETFDH-206ENST00000511912 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 IKZF4-202ENST00000431367 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC092819.1-201ENST00000519981 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC012313.5-201ENST00000594816 2517 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SSUH2-201ENST00000317371 2561 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ELOVL7-201ENST00000425382 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 DCUN1D3-202ENST00000563934 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 OTOG-201ENST00000342528 4992 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 TDRD3-201ENST00000196169 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AL390838.1-201ENST00000423515 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 C1RL-AS1-201ENST00000382215 2086 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PRIMPOL-209ENST00000512834 2174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PDIA6-204ENST00000404824 2236 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PMEPA1-203ENST00000347215 4546 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CAPRIN1-202ENST00000389645 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 HDAC8-214ENST00000439122 2338 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 GALNT14-203ENST00000406653 2496 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LMO7DN-201ENST00000318245 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AQP7P1-201ENST00000412626 1045 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC083873.1-201ENST00000421179 1099 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC127459.2-201ENST00000567395 932 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 DNASE1L3-207ENST00000486455 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 VPS45-211ENST00000535106 2695 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ADGRE5-203ENST00000358600 2751 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ADCY5-201ENST00000309879 2841 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ANGEL1-205ENST00000557179 1427 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LMCD1-202ENST00000397386 1501 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PKMP1-201ENST00000455804 1523 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PIMREG-206ENST00000572595 1551 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 FAM71F1-201ENST00000315184 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 C10orf128-201ENST00000374148 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LINC01898-201ENST00000564156 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 OAS1-203ENST00000452357 1990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CHPF2-201ENST00000035307 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CYP26B1-202ENST00000412253 4025 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 NBPF1-204ENST00000432949 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 HIPK1-AS1-204ENST00000450706 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 POLR2J4-202ENST00000427076 6466 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 KLF6-207ENST00000542957 4537 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ZNRD1ASP-219ENST00000448093 2296 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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