Protein–RNA interactions for Protein: Q86UN3

RTN4RL2, Reticulon-4 receptor-like 2, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RL2Q86UN3 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 PMEL-218ENST00000552882 2516 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 SEC61A1-201ENST00000243253 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 SUCLG2-AS1-202ENST00000482677 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 SCML4-202ENST00000369021 2056 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 KCNH8-201ENST00000328405 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 ZFYVE27-206ENST00000393677 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 LTF-201ENST00000231751 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 SLC25A30-207ENST00000539591 3608 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 IMMT-207ENST00000449247 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 LINC00954-201ENST00000433669 2472 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 ACSBG1-214ENST00000560817 2462 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 SMAD3-204ENST00000540846 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 TTLL13P-206ENST00000641754 2256 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 MROH7-204ENST00000409996 2977 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 RIC3-203ENST00000343202 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 WASHC5-201ENST00000318410 4187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RTN4RL2Q86UN3 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 MEI1-201ENST00000401548 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RTN4RL2Q86UN3 TYRO3-202ENST00000559066 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RTN4RL2Q86UN3 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RTN4RL2Q86UN3 NCDN-202ENST00000373243 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 SLC10A1-201ENST00000216540 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 ZNF221-202ENST00000587682 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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RTN4RL2Q86UN3 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 PNPLA6-203ENST00000450331 4457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 AARS-201ENST00000261772 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 EPHB6-202ENST00000422643 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 ZNF550-205ENST00000457177 3376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 MRS2-203ENST00000378386 3313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 LINC00969-212ENST00000445430 4208 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 IRF5-203ENST00000402030 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 NCAM1-230ENST00000621850 2787 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 GPR132-201ENST00000329797 3660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 COX6B2-209ENST00000590900 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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