Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms