Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AUP1Q9Y679 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AUP1Q9Y679 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms