Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Z0

BACE2, Beta-secretase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE2Q9Y5Z0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BACE2Q9Y5Z0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BACE2Q9Y5Z0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE2Q9Y5Z0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE2Q9Y5Z0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE2Q9Y5Z0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE2Q9Y5Z0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE2Q9Y5Z0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE2Q9Y5Z0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE2Q9Y5Z0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE2Q9Y5Z0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE2Q9Y5Z0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE2Q9Y5Z0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BACE2Q9Y5Z0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE2Q9Y5Z0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BACE2Q9Y5Z0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BACE2Q9Y5Z0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BACE2Q9Y5Z0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BACE2Q9Y5Z0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE2Q9Y5Z0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE2Q9Y5Z0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE2Q9Y5Z0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE2Q9Y5Z0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE2Q9Y5Z0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE2Q9Y5Z0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE2Q9Y5Z0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms