Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A3BPQ9Y5P4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A3BPQ9Y5P4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms