Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB12Q9Y5F1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms