Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF6Q9Y4K3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms