Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCAF1Q9Y4C2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCAF1Q9Y4C2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCAF1Q9Y4C2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCAF1Q9Y4C2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCAF1Q9Y4C2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCAF1Q9Y4C2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCAF1Q9Y4C2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCAF1Q9Y4C2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCAF1Q9Y4C2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCAF1Q9Y4C2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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