Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC42.26■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC42.24■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC42.24■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.35
DCAF1Q9Y4B6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
DCAF1Q9Y4B6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms