Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRRAPQ9Y4A5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms