Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms