Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COQ4Q9Y3A0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ4Q9Y3A0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms