Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms