Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
THRAP3Q9Y2W1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
THRAP3Q9Y2W1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms