Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFSF13BQ9Y275 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF13BQ9Y275 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms