Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RCE1Q9Y256 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RCE1Q9Y256 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RCE1Q9Y256 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RCE1Q9Y256 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RCE1Q9Y256 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RCE1Q9Y256 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RCE1Q9Y256 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RCE1Q9Y256 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms