Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
THSD7AQ9UPZ6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
THSD7AQ9UPZ6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
THSD7AQ9UPZ6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
THSD7AQ9UPZ6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms